Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP1P32455 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP1P32455 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP1P32455 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP1P32455 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBP1P32455 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBP1P32455 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms