Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CASQ1P31415 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CASQ1P31415 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CASQ1P31415 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CASQ1P31415 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CASQ1P31415 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CASQ1P31415 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CASQ1P31415 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASQ1P31415 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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