Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms