Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2E2P29084 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms