Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 ITGB5-212ENST00000608657 825 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 LINC01482-202ENST00000587999 591 ntTSL 35.34□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.921e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 AL357153.2-201ENST00000556646 565 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.318e-11■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.348e-11■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-11■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.578e-11■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.033e-27■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 27.62□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 36.89□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MIER3-201ENST00000336942 601 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MIER3-209ENST00000480115 394 ntTSL 54.03□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MIER3-208ENST00000452157 5240 ntTSL 1 (best)3.26□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.952e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.062e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SUCLG2-202ENST00000460567 1596 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.911e-8■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 416.09■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.984e-10■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.174e-10■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.544e-10■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SPATA18-209ENST00000511028 1919 ntTSL 220.35■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SPATA18-205ENST00000505320 1911 ntTSL 512.2□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 34.34□□□□□ -1.719e-12■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-204ENST00000526717 815 ntTSL 318.39■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-209ENST00000532950 888 ntTSL 317.53■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-207ENST00000531807 732 ntTSL 54.39□□□□□ -1.711e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.831e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-206ENST00000531421 497 ntTSL 53.6□□□□□ -1.831e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.981e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.031e-9■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 13e-16■■■■■ 28.2
PTBP1P26599 KLHL22-208ENST00000470335 824 ntTSL 216.67■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-207ENST00000467977 761 ntTSL 513.75□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-205ENST00000466478 593 ntTSL 513.12□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-207ENST00000458248 742 ntTSL 312.75□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-212ENST00000494929 550 ntTSL 412.6□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-205ENST00000444967 1045 ntTSL 312.49□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-204ENST00000443285 792 ntTSL 412.04□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-203ENST00000431430 572 ntTSL 411.93□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-211ENST00000490556 708 ntTSL 311.02□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-215ENST00000491086 1104 ntTSL 210.93□□□□□ -0.669e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-209ENST00000479601 1389 ntTSL 510.73□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-208ENST00000467996 767 ntTSL 59.86□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 KLHL22-206ENST00000451553 724 ntTSL 38.61□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-211ENST00000470151 701 ntTSL 36.67□□□□□ -1.349e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-212ENST00000474348 1027 ntTSL 56.6□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-210ENST00000468648 570 ntTSL 54.31□□□□□ -1.729e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-204ENST00000459632 1008 ntTSL 43.78□□□□□ -1.89e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-206ENST00000466795 586 ntTSL 42.66□□□□□ -1.989e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 RNF13-214ENST00000490631 583 ntTSL 32.64□□□□□ -1.999e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 STXBP6-207ENST00000550887 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.212e-11■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 DLC1-205ENST00000506171 560 ntTSL 44.01□□□□□ -1.772e-11■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-204ENST00000525994 390 ntTSL 412.15□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-214ENST00000534613 737 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-213ENST00000534422 702 ntTSL 58.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 BTBD11-203ENST00000415943 723 ntTSL 514.56□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 BTBD11-207ENST00000550706 667 ntTSL 513.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 PPFIBP2-220ENST00000532172 817 ntTSL 36.24□□□□□ -1.413e-8■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 PPFIBP2-215ENST00000530081 545 ntTSL 44.22□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 28.1
PTBP1P26599 SNX13-206ENST00000474067 603 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-13■■■■■ 28.1
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 237.2 ms