Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA6P23229 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms