Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD247P20963 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD247P20963 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD247P20963 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms