Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASTP20810 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASTP20810 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASTP20810 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASTP20810 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASTP20810 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms