Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L5P0DN76 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L5P0DN76 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms