Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-AP01891 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms