Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms