Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECM2O94769 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM2O94769 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms