Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOX1O75936 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOX1O75936 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms