Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB3O43889 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB3O43889 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB3O43889 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms