Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ3O43525 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ3O43525 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms