Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA3O43365 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA3O43365 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA3O43365 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms