Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGSM2O43147 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGSM2O43147 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms