Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A2O14975 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms