Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIT3O14879 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIT3O14879 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms