Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
O00370 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
O00370 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
O00370 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
O00370 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
O00370 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20■□□□□ 0.79
O00370 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
O00370 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
O00370 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms