Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms