Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L13C9JLJ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms