Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf172C9J069 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf172C9J069 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf172C9J069 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf172C9J069 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms