Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms