Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF316A6NFI3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms