Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C5orf49A4QMS7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms