Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms