Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANGPTL3Q9Y5C1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms