Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF330Q9Y3S2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms