Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCQ9Y266 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDCQ9Y266 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms