Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRID1Q9ULK0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms