Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL3Q9UKT7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL3Q9UKT7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms