Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTNNA3Q9UI47 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms