Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RDH8Q9NYR8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms