Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL28Q9NXS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL28Q9NXS3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms