Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRMT1Q9NXH9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRMT1Q9NXH9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms