Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXD4L1Q9NU39 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms