Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPRSS4Q9NRS4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPRSS4Q9NRS4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPRSS4Q9NRS4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms