Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LHX9Q9NQ69 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms