Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCM1Q9NP62 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms