Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3GQ9HC16 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3GQ9HC16 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms