Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRDE2Q9H7Z3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms