Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLSTN2Q9H4D0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms