Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB1BQ9H0U4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms