Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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