Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZCCHC2Q9C0B9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms