Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms