Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SNHG12Q9BXW3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms