Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A3Q9BRY0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms