Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms